近日,在南方醫(yī)科大學(xué)生物信息技術(shù)系統(tǒng)項目招標(biāo)中,基于四核處理平臺的浪潮天梭TS10000高性能科學(xué)計算系統(tǒng)成功中標(biāo)。據(jù)了解,采用四核處理單元構(gòu)建的TS10000高性能科學(xué)計算系統(tǒng)在廣東省還是首次,此次成功應(yīng)用將把廣東省的生物信息計算水平提高到一個新的水平。
生物信息研究是當(dāng)今世界科技發(fā)展的熱點之一,在食品、制藥、疾病防治等眾多領(lǐng)域廣泛應(yīng)用。南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)信息檢測技術(shù)重點實驗室隸屬于南方醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院腫瘤研究所,長期致力于生物信息技術(shù)的分析和科研工作,曾經(jīng)成功發(fā)現(xiàn)SARS病毒致命的主要物質(zhì)成分,為治療SARS藥物的問世提供了可能。但是,現(xiàn)代生物信息研究對大規(guī)模科學(xué)計算有很深的依賴,平臺性能對于科研進度及質(zhì)量影響很大,南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)信息檢測技術(shù)重點實驗室負(fù)責(zé)人表示,此次采用代表我國計算機業(yè)最高技術(shù)水平的浪潮天梭系統(tǒng),將極大提高實驗室的大規(guī)模數(shù)據(jù)處理能力。”
此次浪潮中標(biāo)關(guān)鍵正是在于掌握了用戶應(yīng)用需求脈搏。隨著實驗室的不斷的發(fā)展,亟需一套高性能服務(wù)器平臺,綜合運用計算機科學(xué)、生物學(xué)的各種工具來闡明和理解大量數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。通過高性能服務(wù)器集群的并行算法,對獲取的生物信息進行分配、分析、存儲、解釋,同時,還要滿足基因比對排列運算、基因語言與調(diào)控、功能基因組學(xué)等自行開發(fā)的應(yīng)用需要。浪潮服務(wù)器的負(fù)責(zé)人介紹,這種應(yīng)用兼有計算密集型和通訊密集型的特點,浪潮提供的基于Intel四核處理節(jié)點平臺的天梭TS10000集群系統(tǒng),采用5+1的計算/管理配備方案,處理核心總數(shù)達到了40個,通過千兆以太網(wǎng)絡(luò)進行各節(jié)點間的并行通訊和高速交換運算,充分滿足客戶對高性能計算系統(tǒng)的需要。在具體實施中,這套天梭TS10000高性能集群系統(tǒng)性能卓越、穩(wěn)定的運行各類軟件,并行效率與加速比分別高達80%和1.7,實際表現(xiàn)大大超出了用戶預(yù)期。

2007-01-01